مساله نواب صفوی، سلطان بد بود نه سلطنت بد؛ چنانکه او حتی به تدوین وظایف درست وزارت دربار هم دست زده است. او با لحاظ ساختار موجود، به شرح وظایف آنها می‌پردازد و هیچ الگوی بدیل یا بدیعی که به لحاظ شکل و ساختار متفاوت از نظام مستقر باشد، ارائه نمی‌کند.

حاج مهدی عراقی درباره اختلاف نواب صفوی با آیت‌الله کاشانی در مورد شمس قنات آبادی می‌گوید: مرحوم نواب معتقد بود که او جاسوس است. سر همین قضیه، نواب صفوی اواخر نهضت، از آیت‌الله کاشانی جدا می‌شود.

به خلخالی گفتم ما نواب صفوی می‌خواهیم با ۲۵ سال تکامل، متاسفانه شما نواب صفوی ۲۵ سال پیش از او هم نیستید....خلخالی «فدائیان اسلام بنیانگذاران» را تشکیل داد...شهریار شفیق (خواهرزاده شاه) را ما ترور نکردیم. ما اصلا از آن جریان باخبر نبودیم، قطعا اگر مطلع می‌شدیم، نفی می‌کردیم. بنظرم آقای خلخالی هم دخالتی در این قضیه نداشت. منتهی همیشه روی موج سوار می‌شد... خبر ترور شفیق چون بازتاب داخلی نداشت ما سکوت کردیم.